1. ให้การดูแลรักษาดังนี้
2. ถ้าไม่ดีขึ้นใน 4 สัปดาห์ หรือพบรอยปริอยู่นอกแนวกึ่งกลางของผนังด้านหลังหรือด้านนอก (ซึ่งอาจมีสาเหตุอื่นๆ เช่น โรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์ เอดส์มะเร็ง เป็นต้น) ควรส่งโรงพยาบาลเพื่อตรวจหาสาเหตุ
ในรายที่เป็นแผลปริปากทวารหนักแบบเรื้อรังแพทย์ผู้เชี่ยวชาญจะให้การรักษาด้วยการฉีดสารโบทูลิน (มีชื่อการค้า เช่น Botox) เข้าไปในหูรูดชั้นใน (internal sphincter) เพื่อให้กล้ามเนื้อหูรูดคลายตัว ยานี้จะออกฤทธิ์นาน 3 เดือน ถ้าหลังรักษาด้วยวิธีนี้ 3 เดือนแล้วมีอาการกำเริบอีกก็อาจต้องผ่าตัดแก้ไข ซึ่งมักจะได้ผลดีส่วนใหญ่มักจะหายขาด ประมาณร้อยละ 10–20 อาจกลับเป็นซ้ำ